İstanbul 6. İdare Mahkemesi, 7 Mayıs 2013 tarihinde yaptığı inceleme sonucu Gezi Parkı’na Topçu Kışlası yapılmasına ilişkin yürütmeyi durdurma kararı verdi. Kültür ve Turizm Bakanlığı ise bu karara itiraz etti. Bakanlığın itirazını değerlendiren mahkeme heyeti, oyçokluğuyla yürütmeyi durdurma kararını yerinde buldu. Kararın gerekçesinde ise İstanbul 1. İdare Mahkemesi’nin Taksim Meydanı’yla ilgili bütün projeleri iptal ettiği ortaya çıktı. 

Kararda, Topçu Kışlası’nın yeniden yapılmasıyla ilgili projenin dayanağı olan 1/5000 ve 1/1000 ölçekli planların 1. İdare Mahkemesi’nce 6 Haziran 2013 tarihinde iptal edildiği belirtildi. Karar, Taksim’de çalışmaları devam eden yayalaştırma, battı-çıktı, Gezi Parkı ve Topçu Kışlası gibi bütün projeleri kapsıyor. Gezi Parkı’nda Topçu Kışlası’nın yeniden inşası ile ilgili projenin Taksim Meydanı Yayalaştırma Projesi’nin plan notlarında yer aldığı ifade edilerek, “Projeye dayanak teşkil eden imar planları yargı kararıyla iptal edilen bu davada hukuka uygunluk görülmemiştir” denildi. Bu karara, mahkeme başkanı tarafından muhalefet şerhi yazıldı.