İzmir 2. Ağır Ceza Mahkemesinde yapılacak duruşmada Brunson, “örgüte üye olmamakla birlikte örgüt adına suç işlediği” gerekçesiyle 15 yıla kadar, “Devletin güvenliği bakımından niteliği itibarıyla gizli kalması gereken bilgileri siyasal ve askeri casusluk maksadıyla temin etmek” suçlamasından 20 yıla kadar hapis cezası talebiyle yargılanacak. Papaz Brunson hakkında bazı Cemaat üyeleriyle görüştüğü, birlikte “maklube” yediği suçlaması yapılmıştı. Brunson’un ayrıca, özellikle Kürt vatandaşların yaşadığı bölgelerde sistematik bir çalışma yürüttüğü öne sürülmüş bu amaçla İzmir’de sadece Kürt kökenli vatandaşların alındığı “Mesihin Kürdi Kilisesi”ni kurduğu suçlaması yöneltilmişti. Papaz Brunson’a yöneltilen suçlamalar arasında Suriye’nin Kobani’ne gitmesi de yer alıyor. İddianamede Brunson’un Gezi Parkı olaylarının organizasyonunda da yer aldığı ileri sürülüyor.